注册公司与合伙不同，如果营业执照是合伙营业执照，应该共同所有，不存在应该给谁，如果是注册公司的，私底下合伙的，营业执照在法律是归法人所有的，具体私底下协商。可以另外注册一个营业执照给另一个人，做出适当补偿。至于怎么协调。区别一是老营业执照有5年资质，牌子老。考虑第二点因素是，新注册一个营业执照也要花不少钱，新开一个诊所也花不少钱。注册公司与合伙的不同，大致有以下几点：1、注册公司为法人，有永久延续性。而合伙则不是法人，随合伙人丧亡而解散。2、注册公司与其成员属不同法律主体，两者权利义务不同。合伙企业与和各合伙人唇齿相依，资产和义务互通。3、作为法人，注册公司有独立的财产，能独立承担责任；合伙不具有独立的财产，合伙的财产由合伙人共同所有。无限合伙的合伙人互负无限连带责任，有限合伙中的无限合伙人对合伙债务负无限责任。4、注册公司的行动准则是公司的章程大纲和章程细则，凡接受该大纲和细则的人，可通过持有股份而加入公司，成为公司的成员。但除董事、经理外，公司的成员并无经营权。各合伙人之间是通过合伙合约联接起来的，没有各合伙人的同意，第三人不能加入合伙。各合伙人和所在地及地址；2、合伙人姓名及其家庭地址；3、合伙企业的经营以及设定的存续期限；4、合伙企业的设立日期；5、合伙人的权利和义务；6、合伙人的投资形式及其计价方法；7、合伙的退伙和入伙的规定；8、损益分配的原则和比率；9、付给合伙人贷款的利息；10、付给合伙人的工资；11、每个合伙人可以抽回的资本；12、合伙人死亡的处理以及继承人权益的确定；13、合伙企业结账日和利润分配日；14、合伙企业终止以及合伙财产的分配方法；15、其他需经全体合伙人同意的事项。