1、银行性质不同
中国农业发展银行是属于政策性银行，作用是筹集农业政策性信贷资金，代内理财容政性支农资金的拨付等，主要的业务是办理粮油肉类等贷款和补贴资金拨付等。
中国农业银行属于大型商业银行，主要是吸收公众存款，发放短期、中期和长期贷款； 办理国内外结算。
2、成立时间不同
中国农业银行是中国四大银行之一，最初成立于1951年，是新中国成立的第一家国有商业银行 ，也是中国金融体系的重要组成部分。
中国农业发展银行是根据中华人民共和国国务院1994年4月19日发出的《关于组建中国农业发展银行的通知》（国发199425号）成立的国有农业政策性银行 ，直属国务院领导。
3、经营目的不同
中国农业银行是商业银行，一切行为的最终目的是为了盈利。
中国农业发展银行是政策性银行，是不以盈利为目的的，以政策帮扶为主，是辅助国家政策的。
4、两家银行的总部地点不同
中国农业银行的总部位于北京建国门内大街69号；而中国农业发展银行的总部位于北京市西城区月坛北街甲2号。