1、所有权关系不同
债券基金反映的是投资者跟基金管理人之间的信托关系，而债券内反映的是一种债权债务容关系。
2、投资方向不同
债券基金属于信托工具，主要投资方向是债券等有价证券，是一种间接投资方式;而债券属于融资工具，主要投向实业，是一种直接投资方式。
3、收益稳定性不同
投资者购买单一债券，起收益率可以根据购买价格、固定利率、现金流以及到期后的本金计算其投资收益率;但债券基金作为一组不同债券的组合，尽管投资者也会定期获得收益分配，但分配的收益有升有降，因此收益率较难计算和预测。
4、到期日不同
一般单一债券会有确定的到期日，而债券基金由一组具有不同到期日的债券组成，因此债券基金并没有一个确定的到期日，只能根据债券基金所持有的所有债券计算出一个平均到期日。
5、投资风险不同
利率风险：单一债券离到期日越近，所承担的利率风险就会越小。而债券基金没有固定到期日，所承担的利率风险是根据债券的平均到期日来估算的，因为债券基金的平均到期日通常相对固定，因此债券基金所承担的利率风险也会保持在一定的水平。